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Colloque
La compréhension de différents phénomènes biologiques observés à la surface des cellules passe par l'étude des interactions lipides-protéines responsables de l'ancrage et de la stabilisation des protéines membranaires. Par une approche théorique faisant appel aux techniques de simulations par dynamique moléculaire, il est possible de caractériser ces interactions au niveau atomique. Une méthode de construction d'un système explicite composé d'une protéine et d'une bicouche phospholipidique (DMPC) solvatée a été développée et appliquée à l'étude de la mélittine, modèle d'une hélice-a amphiphile et connue pour son activité lytique. Une trajectoire de dynamique moléculaire d'une durée de 1000 psec a été générée …
