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Un des défis majeurs de la recherche sur les ovules, les embryons ou encore les cellules folliculaires obtenues par ponction ovarienne demeure la faible quantité de tissus récupérable. Les technologies progressent rapidement et de nouvelles voies se dessinent pour l'amplification du transcriptome de quelques embryons ou encore de quelques milliers de cellules. Par contre ces systèmes d'amplifications entraînent parfois, la génération de cDNA tronqués ou des biais quantitatifs importants ou la suppression de messagers rares. Ces limitations doivent être compensées par le recours à des validations de plus en plus exhaustives pour en extirper l'information pertinente.